Sejarah STT-NF diawali pada tahun 1994 dengan berdirinya lembaga Nurul Fikri Computer & Statistics (NCS), atau disebut juga sebagai NF Computer. Pada 1998, NF Computer mulai menyediakan pelatihan Linux dan aplikasi Open Source kepada masyarakat luas. Pada tahun 2000, NCS berubah nama menjadi Lembaga Pendidikan Komputer Nurul Fikri (LPK-NF), yang kemudian berganti nama kembali menjadi Lembaga Pendidikan dan Pengembangan Profesi Terpadu Nurul Fikri (LP3T-NF). Pada tahun 2007, LP3T-NF mulai menyelenggarakan pendidikan teknologi informasi dua tahun yang terakreditasi Badan Akreditasi Nasional Pendidikan Non Formal. 

Tingginya permintaan dan minat masyarakat dan industri terhadap keahlian di bidang teknologi informasi menyebabkan pada tahun 2009 didirikan Yayasan Profesi Terpadu Nurul Fikri yang mengajukan ijin pendirian STT-NF sebagai perguruan tinggi formal di bidang teknologi. Pada tanggal 13 Agustus 2012, STT-NF resmi berdiri dengan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No. 269/E/O/2012 dengan dua program studi yaitu Sistem Informasi dan Teknik Informatika. Pada tahun 2022, seiring dengan perkembangan ekonomi digital yang pesat, STT-NF menambah program studi baru yang Bisnis Digital.